产品货号:
WH0127
中文名称:
石蜡包埋组织miRNA提取试剂盒
英文名称:
FFPE miRNA Extraction Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒提供独特的裂解和孵育条件,可以逆转福尔马林对RNA造成的交联。在二甲苯脱蜡后,利用特别研制的裂解缓冲液处理,可有效地将RNA从组织切片中释放出来,并用DNase I消化,避免了基因组DNA污染。经硅基质膜纯化后可获得>18nt的RNA,产物可直接用于RT-PCR、RT-qPCR、Northern Blot Analysis、MicroArray Analysis等下游实验。
试剂盒特点:
提取流程图:
实验实例:
选取大鼠肝石蜡切片,每片厚度约10μm。提取该切片的miRNA,再依次进行反转录(货号:WH0131)和荧光定量PCR(货号:WH0132),检测目的miRNA。
A:提取两张切片样本,并检测miR-16的表达量。每张切片设立2个重复。扩增曲线显示本试剂盒能够高效稳定的提取石蜡切片样本中的miRNA。
B:本试剂盒与国外知名公司A和B的同类试剂盒提取组织切片的miRNA,每个试剂盒提取两张切片,所有切片均来自同一组织样本。提取之后进行反转录并检测miR-194的表达量。图中实验结果显示,本试剂盒提取得率略高于同类竞品试剂盒。
试剂盒组成:
储存条件:15~25℃,DNase I,缓冲液RDD和RNase-Free ddH2O(管装)置于2~8℃保存
自备试剂:
二甲苯,无水乙醇
注意事项:(请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。)
起始材料:
操作步骤:
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试剂盒特点:
- 针对性强:专为提取FFPE中的miRNA设计,试剂盒组分进行特别优化;
- 纯度高:柱法纯化,产物无gDNA和盐离子污染;
- 简单快速:2h内即可获得高质量的miRNA。
提取流程图:
实验实例:
选取大鼠肝石蜡切片,每片厚度约10μm。提取该切片的miRNA,再依次进行反转录(货号:WH0131)和荧光定量PCR(货号:WH0132),检测目的miRNA。
A:提取两张切片样本,并检测miR-16的表达量。每张切片设立2个重复。扩增曲线显示本试剂盒能够高效稳定的提取石蜡切片样本中的miRNA。
B:本试剂盒与国外知名公司A和B的同类试剂盒提取组织切片的miRNA,每个试剂盒提取两张切片,所有切片均来自同一组织样本。提取之后进行反转录并检测miR-194的表达量。图中实验结果显示,本试剂盒提取得率略高于同类竞品试剂盒。
试剂盒组成:
组分 | 规格 |
裂解液RF | 12mL |
缓冲液RB | 2×12mL |
漂洗液RW | 12mL |
Proteinase K | 500μL |
RNase-Free ddH2O(瓶装) | 15mL |
RNase-Free吸附柱CR3(含2mL收集管) | 50套 |
DNase I | 1500U |
缓冲液RDD | 4mL |
RNase-Free ddH2O(管装) | 1mL |
RNase-Free离心管(1.5mL) | 50个 |
储存条件:15~25℃,DNase I,缓冲液RDD和RNase-Free ddH2O(管装)置于2~8℃保存
自备试剂:
二甲苯,无水乙醇
注意事项:(请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。)
- 第一次使用前应在漂洗液RW中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
- DNase I储存液的配制
将DNase I干粉(1500U)溶解在550μL RNase-Free ddH2O中,轻柔混匀,分装后-20℃贮存(可保存9个月)。
注意:从-20℃融化后的DNase I储存液保存于4℃(可保存6周),不要再次冻存。
起始材料:
- 标准的福尔马林固定石蜡包埋程序也常常会造成核酸的片段化。为了尽量降低RNA片段化的可能性,应该按照以下操作步骤进行样本处理:
- 组织切除后应尽快浸入4%~10%的福尔马林溶液中;
- 固定时间最好为14-24h(固定时间过长会导致RNA片段化更严重,不利于下游的试验);
- 样本包被之前必须彻底脱水。
- 组织切除后应尽快浸入4%~10%的福尔马林溶液中;
- 应采用新鲜的FFPE组织切片,切片厚度不超过10μm,切片过厚可能会造成RNA得率低,每次制备采用的切片数应不超过8片,表面积应不超过250mm2。
- 如果没有起始样本的信息,建议初次制备采用的切片数应不超过2片,然后根据实验结果,下次制备采用的切片数可以进行调整,但应不超过8片。
操作步骤:
- 将石蜡样品切成5~10μm厚的片状。
注意;如果样品表面暴露于空气中,最初的2~3片弃掉不用。 - 迅速将2-8张切片置于1.5mL RNase-free的离心管中,加入1mL二甲苯,剧烈涡旋10sec。
- 室温(15~25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min。
- 用枪头吸除上清,小心不要吸到沉淀。
- 加入1mL无水乙醇于沉淀中,涡旋混匀。
- 室温(15~25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min。
- 用枪头吸除上清,小心不要吸到沉淀(用一个新的枪头小心吸出残余的乙醇)。
- 打开管盖,室温(15~25℃)或37℃放置10min直至残余的乙醇挥发完全。
注意:完全去除残余的乙醇很重要,残余的乙醇会对RNA产生影响。 - 加入150μL裂解液RF以及10μL Proteinase K于沉淀中,彻底涡旋混匀。
- 55℃孵育15min之后80℃孵育15min。
- 冰上放置3min,12000rpm (~13400×g)离心15min,转移上清至新的2mL RNaseFree离心管中。
- 加入16μL的RDD buffer和10μL的DNase I溶液,颠倒混匀。室温放置15min。简短离心以收集管壁及管盖上的液滴。
- 加入320μL的缓冲液RB,涡旋混匀。
- 加入1120μL的无水乙醇,涡旋混匀(可能会出现沉淀)。
- 转移700μL溶液和沉淀入吸附柱CR3中(吸附柱放在收集管中),12000rpm(~13400×g)离心1min,弃掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
- 重复步骤15,直到所有的溶液和沉淀完全通过吸附柱CR3,弃废液,将吸附柱CR3放回收集管中。
- 向吸附柱CR3中加入500μL漂洗液RW(使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm (~13400×g)离心30~60sec,弃废液,将吸附柱CR3放回收集管中。
- 重复步骤17。
- 室温(15~25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:此步骤目的是将吸附柱CR3中残余的漂洗液去除,漂洗液的残留,可能会影响后续的RT等实验。 - 将吸附柱CR3转入一个新的RNase-Free离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加30~100μL RNase-Free ddH2O,室温放置2min,12000rpm (~13400×g)离心2min。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于30μL,体积过小影响回收效率。RNA溶液请于-70℃保存。
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